目前AFM的工作方式有三種，分別是接觸模式，非接觸模式和敲擊模式。
接觸模式：
就是利用探針與材料表面直接接觸來獲得材料結(jié)構(gòu)和形貌信息的方式，這樣的方式測(cè)試出來的圖像分別率高，但是很容易損傷測(cè)試材料的表面，探針也會(huì)受到材料的污染，同時(shí)可能會(huì)因?yàn)樘结樑c材料表面的粘滯力造成圖像失真；
非接觸式：
顧名思義就是探針與材料表面沒有直接接觸，這樣的方式就避免了接觸模式的一些缺點(diǎn)，探針也不會(huì)受到污染，但是由于探針和材料表面不是直接接觸的(相距5-10nm)，探針和材料表面的原子的作用力較弱，造成了圖像的分辨率較低，而且會(huì)因?yàn)椴牧系谋砻鎻埩κ沟脠D像變形；
敲擊模式：
這是一種較為先進(jìn)的測(cè)試模式，和上述兩種方式都不一樣，就是探針既不是直接接觸材料表面，也不是*脫離表面，而是通過探針不斷垂直敲擊(大約每秒5×104-50×104次)材料的表面來獲得我們所想要的材料表面形貌和結(jié)構(gòu)的信息，這樣就既不會(huì)損壞材料表面也會(huì)得到較高分辨率(當(dāng)然還是沒有接觸模式圖像分辨率高)，因此當(dāng)檢測(cè)柔嫩的樣品時(shí)，AFM的敲擊模式是好的選擇之一。但是測(cè)試的速度相對(duì)較慢。
材料領(lǐng)域的應(yīng)用
1、材料形貌
AFM在水平方向具有0.1-0.2nm的高分辨率，在垂直方向的分辨率約為0.01nm。AFM對(duì)表面整體圖像進(jìn)行分析可得到樣品表面的粗糙度、顆粒度、平均梯度、孔結(jié)構(gòu)和孔徑分布等參數(shù)，還可以對(duì)測(cè)試的結(jié)果進(jìn)行三維模擬，得到更加直觀的3D圖像。
AFM還可以在分子或原子水平直接觀察晶體或非晶體的形貌、缺陷、空位能、聚集能及各種力的相互作用，對(duì)于其性能的預(yù)測(cè)及解釋有著重要的作用。
AFM中雖然不能進(jìn)行元素分析，但它在Phase Image模式下可以根據(jù)材料的某些物理性能的不同來提供成分的信息。
2、晶體生長(zhǎng)機(jī)理
在研究納米晶生長(zhǎng)機(jī)理的時(shí)候，人們希望用顯微手段直接觀察到晶面生長(zhǎng)的過程，AFM為我們提供了在一個(gè)原子級(jí)觀測(cè)研究晶體生長(zhǎng)界面過程的全新有效工具。由于AFM的工作條件要求低，它可以晶體生長(zhǎng)過程原子級(jí)的圖像，為完善和修正現(xiàn)有的晶體生長(zhǎng)理論提供了強(qiáng)大的技術(shù)支撐。
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